La Délégation Ifremer océan Indien mène ou contribue à de nombreux projets autour des thématiques Halieutique, Environnement, Biodiversité marine et Aquaculture.
La Délégation Ifremer océan Indien contribue à la mise en œuvre du Système d'Information Halieutique (SIH) et de la Directive Cadre sur l'Eau (DCE) dans les territoires français de l'océan Indien.
La Délégation Ifremer océan Indien contribue au développement, au déploiement et au maintien en conditions opérationnelles de nombreux outils dans sa zone et ses domaines de compétences.
Le projet CAMP SOOI - Connectivité des Aires Marines Protégées du Sud-Ouest de l'Océan Indien a pour objectif de contribuer à identifier des unités de gestion efficace de la biodiversité marine dans le sud-ouest de l’océan Indien.