Le contexte particulier de La Réunion (absence d’Agence de l’Eau, moyens opérationnels plus limités…) a conduit l’Etat à désigner ses services de la Direction de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement (DEAL) comme opérateur de la mise en œuvre de la Directive Cadre sur l'Eau (DCE) dans ses départements d’Outre-Mer. Entre 2008 à 2012, la DEAL s'est appuyée sur la Délégation Ifremer océan Indien (DOI) qui a assumé la mission d'assistance à maîtrise d'ouvrage à travers différents projets et notamment les projets "BON ETAT" puis "BON ETAT II".
Le projet HYDRORUN, initié à la fin de l'année 2009, visait à développer une plateforme de modélisation hydrodynamique couvrant l'ensemble de l'île de la Réunion.